南开大学学报(自然科学版) ›› 2018 ›› Issue (2): 9-13.

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含有前列腺癌风险性SNP rs10486567位点潜在增强子座位在前列腺癌细胞中功能的研究

莫文慧(1992-),女,广东珠海人,硕士研究生.   

  • 出版日期:2018-04-20 发布日期:2018-12-10
  • 基金资助:
    国家自然科学基金(81572784); 天津市科技计划项目(15JCYBJC50900);

  • Online:2018-04-20 Published:2018-12-10

摘要: 遗传是前列腺癌发展成临床型疾病的重要危险因素.前期采用生物信息学分析发现,7号染色体短臂15区2带(7p 15.2)的SNP rs10486567是前列腺癌的独立风险因子,并发现该SNP位点定位于一个潜在增强子内部.本研究通过CRISPR-Cas9技术在22RV1细胞系中敲除该增强子座位后发现肿瘤细胞迁移能力显著降低;并利用Capture-C技术结合RNA-seq方法,发现该增强子座位与约800 kb外的HOXA基因区段存在远距离染色质相互作用,并调控HOXA基因簇的表达.研究提示含有风险性SNP rs10486567的增强子区段调控HOXA7、HOXA4等基因的表达,进而影响肿瘤细胞的恶性转移进程. 

关键词: 前列腺癌, SNP rs10486567, Capture-C, CRISPR-Cas9;