南开大学学报(自然科学版) ›› 2022 ›› Issue (3): 73-.

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影响细菌种群(太岁组织)结构关键因素的研究

  

  • 出版日期:2022-06-20 发布日期:2022-07-01

  • Online:2022-06-20 Published:2022-07-01

摘要: 探索了太岁取样部位和DNA提取前处理2个因素对细菌菌群结构的影响,并获知真实的优势菌群信息.对表里部位重复取样样品,施加水浸提、热溶解与微孔过滤组合成的3种前处理,提取的DNA用Miseq平台测序,挖掘出共有、占比高、有最高丰度OTU支撑的菌群.发现太岁中细菌种类丰富,大部分是杂菌,由表至内,多数类群不明原因消失,多样性和丰度降低,假单胞菌属(Pseudomonas)丰度显著升高;其与不动杆菌属(Acinetobacter)、根瘤菌属(Rhizobium)和鞘脂菌属(Sphingobium)为共有优势属;3种前处理方法获得的菌群结构近似,以内部组织直接热溶解过膜法为最优,其假单胞菌属占比达48.32%.

关键词: 太岁, 细菌, 组织前处理, DNA 提取, 菌群结构